Un pequeño óleo en que el se representa el rostro de Cristo, pintando por Rembrandt Van Rijn en 1647, sirve de hilo conductor a las peripecias de esta novela en laque, a través de los siglos y hasta el presente cubano, aparecen varios personajes empeñados en practicar una de las esencias de la condición humana: la búsqueda de la libertad individual. Pero, aun en las sociedades que se han preciado de ofrecer mayores espacios a los ciudadanos, esa necesidad humana y su obtención entrañan un precio, muchas veces elevado y hasta fatal.
Herejes es una novela compleja y ambiciosa, en la que Leonardo Padura vuelve a convocar a su personaje fetiche, el expolicía Mario Conde, para que lo ayude a develar el pasado y el presente de unos personajes que resultarán inolvidables: el sefardí Elias Ambrosius Montaíbo de Ávila y su maestro, el mismísimo Rembrandt; el asquenazí Daniel Kaminksy y su tío Pepe Cartera, vinculados al vergonzoso episodio del trasatlántico Saint Louis; y la joven emo Judy Torres, salida de las entrañas de la contemporaneidad cubana.